Das Hoefer 2D-System besteht aus der IEF100 Isoelektrischen Fokussierungs-Einheit für die erste Dimension und der SE900 Vertikalgel-Elektrophoreseeinheit für die SDS-PAGE der 2. Dimension.

Mit der IEF 100-Einheit werden die Qualität und die Geschwindigkeit der IEF-Trennungen verbessert. Das Einzeltank-Design der SE 900 ermöglicht einen Lauf ohne Undichtigkeiten und die Möglichkeit, den Puffer wieder zu verwenden. Die SE 900-Kammer ist einfach zu bedienen, verwendet ein Minimum an Teilen und bietet eine effiziente Kühlung. Die erste Dimension kann mit IPG-Streifen jeder kommerziell erhältlichen Länge bis zu 24 cm (z.B. SERVA IPG BlueStrips) durchgeführt werden. Bis zu 6 IPG-Streifen können gleichzeitig fokussiert werden. Der integrierte 12,000 Volt Stromversorger mit seinen hohen Spannungs- und Stromwerten ermöglicht schnelle Laufzeiten und hat sowohl einen Ethernet- als auch einen RS232-Ausgang an der Frontseite der Einheit.

Mit dem Multi-Gelgießstand der SE 900 können gleichzeitig 6 identische Gele gegossen werden, was eine hohe Reproduzierbarkeit der selbstgegossenen Gele ermöglicht.