Zwitterionische Detergenzien wie CHAPS oder SB12 kombinieren die Eigenschaften von ionischen und nichtionischen Detergenzien. 

Sie tragen eine positiv und eine negativ geladene Gruppe, haben aber, wie nichtionische Tenside, keine Nettoladung (bei CHAPS und Sulfobetainen im pH-Bereich von 2 -12). 

Außerdem fehlt ihnen die Leitfähigkeit und elektrophoretische Mobilität und sie binden nicht an Ionenaustauscherharze. Sie sind jedoch in der Lage - wie ionische Detergenzien - Protein-Protein-Wechselwirkungen aufzubrechen.