Die präzise Bestimmung der Proteinkonzentration ist ein wesentlicher Bestandteil im Proteinanalyse-Workflow. Es ist zwar eine große Anzahl verschiedener Proteinbestimmungs-Methoden etabliert, vor der Anwendung muss aber für jeden dieser Assays die Eignung für die spezifische Applikation geprüft werden. Jede Methode hat ihre spezifischen Vorteile und Einschränkungen und oft ist es notwendig, mehr als einen Proteinbestimmungs-Assay für eine Applikation durchzuführen.

Bradford-Reagenz und der SingleQuant Assay Kit basieren auf der Bindung des Farbstoffs an die Proteine und anschließender direkter Detektion des Farbumschlages assoziiert mit dem gebundenen Farbstoff.
Bradford-Reagenz ist aufgrund der hohen Sensitivität und einfachen Durchführung besonders geeignet für die schnelle Abschätzung der Proteinkonzentration. Allerdings wird der Assay durch in der Probe enthaltene Detergenzien gestört.
Der SingleQuant Assay Kit zeichnet sich nicht nur durch einen weiten linearen Messbereich aus, sondern auch die Anwesenheit von Detergenzien wie SDS oder CHAPS sowie reduzierender Agenzien wie DTT interferiert nicht mit der Messung.

Die BCA Protein Assay Macro/Micro Kits und der Lowry Kit basieren auf der Reduktion von Kupfer durch Proteine gefolgt von einer Chelatreaktion, die einen farbigen Komplex bildet.
Die BCA Protein Assay Macro/Micro Kits haben den Vorteil, dass sie geringere Bindungsvarianzen zwischen verschiedenen Proteinen zeigen als der Bradford-Assay und kompatibel mit den meisten Detergenzien sind.
Trotz der Entwicklung neuerer Proteinbestimmungkits bleibt der Lowry Kit eine sensitive, akkurate und zweckmäßige Methode für viele Applikationen. Besonders geeignet ist der Kit für die Bestimmung der Proteinkonzentration nach der TCA-Fällung, da durch die Fällung den Assay störende Substanzen entfernt werden.

Eine deutlich höhere Sensitivtät und Genauigkeit der Proteinkonzentrationsbestimmung wird mit Kits erreicht, die auf der Bindung eines Fluoreszenzfarbstoffes an Proteine und der anschließenden Detektion der emittierten Fluoreszenz beruhen.
Der SERVA Purple Protein Quantifizierungs-Assay basiert auf dem umweltfreundlichen Fluoreszenzfarbstoff SERVA Purple. Der Assay hat nicht nur eine sehr hohe Sensitivität, es werden auch hydrophobe, Glyko-, Phospho-Proteine und Peptide präzise angefärbt.